MiSeq - это производительный компактный геномный секвенатор, позволяющий проводить секвенирование по технологии sequencing by synthesis. Возможность использования баркодов увеличивает возможности анализа до 96 образцов. Для прибора существует большое количество наборов, позволяющих получать прочтения разной длины (36-300 нт.) и объема (0,5-15 Гб.) В центре в основном используется набор 2х300, который обеспечивает наиболее длинные прочтения и максимальный объем данных 13-15 Гб.