Публикации ЦКП

EN

Публикации ЦКП

Метагеномика

Chertkova E., Kabilov M.R., Yaroslavtseva O., Polenogova O., Kosman E., Sidorenko D., Alikina T., Noskov Y., Krivopalov A., Glupov V.V., Kryukov V.Y. Links between Soil Bacteriobiomes and Fungistasis toward Fungi Infecting the Colorado Potato Beetle. Microorganisms 2023. 11. 4. 943
Maslennikova V.S., Tsvetkova V.P., Shelikhova E.V., Selyuk M.P., Alikina T.Y., Kabilov M.R., Dubovskiy I.M. Bacillus subtilis and Bacillus amyloliquefaciens Mix Suppresses Rhizoctonia Disease and Improves Rhizosphere Microbiome, Growth and Yield of Potato (Solanum tuberosum L.). Journal of Fungi 2023. 9. 12. 1142
Naumova N.B., Barsukov P.A., Baturina O.A., Rusalimova O.A., Kabilov M.R. Soil Alveolata diversity in the undisturbed steppe and wheat agrocenoses under different tillage. Vavilov Journal of Genetics and Breeding 2023. 27. 6. 703–711
Naumova N., Barsukov P., Baturina O., Rusalimova O., Kabilov M. West-Siberian Chernozem: How Vegetation and Tillage Shape Its Bacteriobiome. Microorganisms 2023. 11. 10. 2431
Naumova N.B., Baturina O.A., Lokteva A.S., Pleshakova V.I., Lescheva N.A., Lorengel T.I., Zolotova N.S., Alekseeva I.G., Kabilov M.R. The effect of dextranal on the gut bacteriobiome of calves. Siberian Journal of Life Sciences and Agriculture 2023. 15. 6
Polenogova O.V., Klementeva T.N., Kabilov M.R., Alikina T.Y., Krivopalov A.V., Kruykova N.A., Glupov V.V. A Diet with Amikacin Changes the Bacteriobiome and the Physiological State of Galleria mellonella and Causes Its Resistance to Bacillus thuringiensis. Insects 2023. 14. 11. 889
Коробова Л.Н., Риксен В.С., Батурина О.А. Микробиоценоз солонца как индикатор изменения среды при замене кормовых севооборотов сеяным лугом. Сибирский Вестник Сельскохозяйственной Науки 2023. 53. 8. 5–14
Кравцова Л.С., Перетолчина Т.Е., Трибой, Небесных И.А., Тупикин А.Е., Кабилов М.Р. Исследование сообществ макробеспозвоночных животных в бухте Большие Коты озера Байкал с использованием ДНК метабаркодинга. Вавиловский Журнал Генетики и Селекции 2023. 27. 6. 694–702
Лаврентьева Е.В., Раднагуруева А.А., Иванов В.Л., Батурина О.А., Бархутова Д.Д. Таксономическое разнообразие микробного сообщества в различных термальных зонах горячего источника Гарга (байкальская рифтовая зона). Природа Внутренней Азии 2023. 3(25). 58–67
Наумова Н.Б., Беланов И.П., Савенков О.А., Степанова М.В., Щемелева Г.В., Батурина О.А., Кабилов М.Р. Почвенный и ризосферный бактериобиом пшеницы при комбинировании гуматов и золы уноса. Почвы и Окружающая Среда 2023. 6. 3. 1–16
Никитина Е.П., Буянтуева Л.Б., Батурина О.А., Гынинова А.Б., Лаврентьева Е.В. Пространственная и таксономическая структура микробных сообществ почв сухостепной зоны селенгинского среднегорья (Западное Забайкалье). Аридные Экосистемы 2023. 29. 3(96). 111–123
Цыренова Д.Д., Зайцева С.В., Дагурова О.П., Батурина О.А., Бархутова Д.Д. Структура фототрофных сообществ пресных озер прибайкалья в условиях интенсивной эвтрофикации. Природа Внутренней Азии 2023. 3(25). 85–99

Геномика бактерий и вирусов

* Grizanova E.V., Krytsyna T.I., Kalmykova G.V., Sokolova E., Alikina T., Kabilov M., Coates C.J., Dubovskiy I.M. Virulent and necrotrophic strategies of Bacillus thuringiensis in susceptible and resistant insects, Galleria mellonella. Microbial Pathogenesis 2023. 175. 105958
Kryukova N.A., Kryukov V.Y., Polenogova O.V., Chertkova Е.А., Tyurin M.V., Rotskaya U.N., Alikina T., Kabilov М.R., Glupov V.V. The endosymbiotic bacterium Wolbachia (Rickettsiales) alters larval metabolism of the parasitoid Habrobracon hebetor (Hymenoptera: Braconidae). Archives of Insect Biochemistry and Physiology 2023. 114. 4. e22053
Pavlova O.N., Tupikin A.E., Chernitsyna S.M., Bukin Y.S., Lomakina A.V., Pogodaeva T.V., Nikonova A.A., Bukin S.V., Zemskaya T.I., Kabilov M.R. Description and Genomic Analysis of the First Facultatively Lithoautotrophic, Thermophilic Bacteria of the Genus Thermaerobacter Isolated from Low-temperature Sediments of Lake Baikal. Microb Ecol 2023. 86. 3. 1604–1619
Prokopyeva E.A., Kurskaya O.G., Solomatina M.V., Sobolev I.A., Saroyan T.A., Dubovitskiy N.A., Derko A.A., Kozhin P.M., Alikina T.Y., Kabilov M.R., Shestopalov A.M., Sharshov K.A. Virological and genetic characteristics of human respiratory syncytial viruses isolated in Russia, 2017-2018. The Journal of Infection in Developing Countries 2023. 17. 02. 251–259
Vlasenko A.V., Novozhilov Yu.K., Bondar A.A., Vlasenko V.A. Phylogeny of trichia brunnea and new names in the genus arcyria (trichiales, myxomycetes). Mikologiya I Fitopatologiya 2023. 57. 6. 385–393

Молекулярная биология и биотехнология

Balabova D.V., Belash E.A., Belenkaya S.V., Shcherbakov D.N., Belov A.N., Koval A.D., Mironova A.V., Bondar A.A., Volosnikova E.A., Arkhipov S.G., Sokolova O.O., Chirkova V.Y., Elchaninov V.V. Biochemical Properties of a Promising Milk-Clotting Enzyme, Moose (Alces alces) Recombinant Chymosin. Foods 2023. 12. 20. 3772
Bulkhin A.O., Zykov V.V., Marchenko D.N., Kabilov M.R., Baturina O.A., Boyandin A.N., Anishchenko O.V., Rogozin D.Y. Long-chain alkenones in the lake sediments of North-Minusinsk Valley (southern Siberia): implications for paleoclimate reconstructions. Organic Geochemistry 2023. 176. 104541
Ochkasova A., Arbuzov G., Kabilov M., Tupikin A., Karpova G., Graifer D. AP lyase activity of the human ribosomal protein uS3: The DNA cleavage sequence specificity and the location of the enzyme active center. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics 2023. 1871. 2. 140880
Мурашкин Д.Е., Беленькая С.В., Бондарь А.А., Ельчанинов В.В., Щербаков Д.Н. Анализ некоторых биохимических свойств рекомбинантного химозина сибирской косули (Capreolus Pygargus), полученного в культуре клеток млекопитающих (cho-k1). Биохимия 2023. 88. 9. 1556–1569
Шарабрин С.В., Бондарь А.А., Старостина Е.В., Кисаков Д.Н., Кисакова Л.А., Задорожный А.М., Рудометов А.П., Ильичев А.А., Карпенко Л.И. Удаление примесной дцРНК из препарата синтезированной матричным синтезом мРНК. Бюллетень Экспериментальной Биологии и Медицины 2023. 176. 12. 723–728

Геномика эукариот

Agafonov A.V., Shabanova E.V., Emtseva M.V., Asbaganov S.V., Morozov I.V., Bondar A.A., Dorogina O.V. Phylogenetic and taxonomic relationships between morphotypes related to Elymus caninus (Poaceae) based on sequence of a nuclear gene GBSS1 (waxy) and sexual hybridization. Journal of Systematics and Evolution 2023. 1–14
Bryzgunova O., Bondar A., Ruzankin P., Tarasenko A., Zaripov M., Kabilov M., Laktionov P. Locus-Specific Bisulfate NGS Sequencing of GSTP1, RNF219, and KIAA1539 Genes in the Total Pool of Cell-Free and Cell-Surface-Bound DNA in Prostate Cancer: A Novel Approach for Prostate Cancer Diagnostics. Cancers 2023. 15. 2. 431
Dyrkheeva N.S., Malakhova A.A., Zakharenko A.L., Okorokova L.S., Shtokalo D.N., Pavlova S.V., Medvedev S.P., Zakian S.M., Nushtaeva A.A., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Khodyreva S.N., Luzina O.A., Salakhutdinov N.F., Lavrik O.I. Transcriptomic Analysis of CRISPR/Cas9-Mediated PARP1-Knockout Cells under the Influence of Topotecan and TDP1 Inhibitor. International Journal of Molecular Sciences 2023. 24. 6. 5148
Frolov A., Lobov A., Kabilov M., Zainullina B., Tupikin A., Shishkova D., Markova V., Sinitskaya A., Grigoriev E., Markova Y., Kutikhin A. Multi-Omics Profiling of Human Endothelial Cells from the Coronary Artery and Internal Thoracic Artery Reveals Molecular but Not Functional Heterogeneity. International Journal of Molecular Sciences 2023. 24. 19. 15032
Kiselev I.S., Kulakova O.G., Baturina O.A., Kabilov M.R., Boyko A.N., Favorova O.O. DNA Methylation Profile of CD14+ Monocytes Changes in Primary Progressive Multiple Sclerosis. Mol Biol 2023. 57. 5. 836–842
Pshennikova V.G., Teryutin F.M., Cherdonova A.M., Borisova T.V., Solovyev A.V., Romanov G.P., Morozov I.V., Bondar A.A., Posukh O.L., Fedorova S.A., Barashkov N.A. The GJB2 (Cx26) Gene Variants in Patients with Hearing Impairment in the Baikal Lake Region (Russia). Genes 2023. 14. 5. 1001
Yunusova N., Dzhugashvili E., Yalovaya A., Kolomiets L., Shefer A., Grigor’eva A., Tupikin A., Kondakova I., Tamkovich S. Comparative Analysis of Tumor-Associated microRNAs and Tetraspanines from Exosomes of Plasma and Ascitic Fluids of Ovarian Cancer Patients. International Journal of Molecular Sciences 2023. 24. 1. 464
Zakharova Y., Marchenkov A., Petrova D., Bukin Y., Morozov A., Bedoshvili Y., Podunay Y., Davidovich O., Davidovich N., Bondar A., Kahlert M., Likhoshway Y. Delimitation of Some Taxa of Ulnaria and Fragilaria (Bacillariophyceae) Based on Genetic, Morphological Data and Mating Compatibility. Diversity 2023. 15. 2. 271
Zakharenko A.L., Malakhova A.A., Dyrkheeva N.S., Okorokova L.S., Medvedev S.P., Zakian S.M., Kabilov M.R., Tupikin A.A., Lavrik O.I. PARP1 Gene Knockout Suppresses Expression of DNA Base Excision Repair Genes. Dokl Biochem Biophys 2023. 508. 1. 6–11
Zolotenkova E.A., Gopanenko A.V., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Malygin A.A. Mutation at the Site of Hydroxylation in the Ribosomal Protein uL15 (RPL27a) Causes Specific Changes in the Repertoire of mRNAs Translated in Mammalian Cells. International Journal of Molecular Sciences 2023. 24. 7. 6173
Киселев И.С., Кулакова О.Г., Батурина О.А., Кабилов М.Р., Бойко А.Н., Фаворова О.О. Сравнение профилей метилирования ДНК мононуклеарных клеток крови больных рассеянным склерозом в стадиях ремиссии и обострения. Журнал Неврологии и Психиатрии им. С.С. Корсакова. Спецвыпуски. 2023. 123. 7–2. 60–64
Синицкий М.Ю., Синицкая А.В., Шишкова Д.К., Асанов М.А., Хуторная М.В., Тупикин А.Е., Кабилов М.Р. Маркеры эндотелиальной дисфункции в клеточных культурах эндотелия при генотоксической нагрузке. Атеросклероз 2023. 19. 3. 313–315

Метагеномика

Grodnitskaya I.D., Karpenko L.V., Pashkeeva O.E., Goncharova N.N., Startsev V.V., Baturina O.A., Dymov A.A. Impact of Forest Fires on the Microbiological Properties of Oligotrophic Peat Soils and Gleyed Peat Podzols of Bogs in the Northern Part of the Sym-Dubches Interfluve, Krasnoyarsk Region. Eurasian Soil Science 2022. 55. 4. 460–473
Lysko S.B., Baturina O.A., Naumova N.B., Lescheva N.A., Pleshakova V.I., Kabilov M.R. No-Antibiotic-Pectin-Based Treatment Differently Modified Cloaca Bacteriobiome of Male and Female Broiler Chickens. Agriculture 2022. 12(1). 24. 1–16
Naumova N., Barsukov P., Baturina O., Rusalimova O., Kabilov M. Soil Mycobiome Diversity under Different Tillage Practices in the South of West Siberia. Life 2022. 12(8). 1169. 1–17
Naumova N., Baturina O., Nechaeva T., Kabilov M. Root and Rhizosphere Microbiome of Tomato Plants Grown in the Open Field in the South of West Siberia under Mineral Fertilization. Horticulturae 2022. 8(11). 1051. 1–19
Naumova N., Kuznetsova G., Alikina T., Kabilov M. Cambisol Mycobiome in a Long-Term Field Experiment with Korean Pine as a Sole Edificator: A Case Study. Applied Microbiology 2022. 2. 3. 470–480
Букин Ю.С., Кравцова Л.С., Перетолчина Т.Е., Федотов А.П., Тупикин А.Е., Кабилов М.Р., Щербаков Д.Ю., Минчева Е.В. ДНК-метабаркодинг бентосных водорослей и ассоциированных с ними эукариот оз. Байкал в условиях быстрых экологических изменений. Вавиловский журнал генетики и селекции 2022. 26. 1. 86–95
Кулыгина Ю.А., Осипенко М.Ф., Аликина Т.Ю. Особенности микробиоты у пациентов с болезнью Крона в зависимости от наличия синдрома избыточного бактериального роста. РМЖ. Медицинское Обозрение 2022. 6. 5. 221–226
Наумова Н.Б., Кабилов М.Р. О биоразнообразии микробиома воздуха. Acta Naturae 2022. 14. 4. 50–56

Геномика бактерий и вирусов

Andreeva I.S., Baturina O.A., Safatov A.S., Solovyanova N.A., Alikina T.Y., Puchkova L.I., Rebus M.E., Buryak G.A., Olkin S.E., Kozlov A.S., Kabilov M.R. Concentration and Composition of Cultured Microorganisms in Atmospheric Air Aerosols in Novosibirsk Depending on the Season. Atmospheric and Oceanic Optics 2022. 35. 6. 667–672
Lukianova A.A., Evseev P.V., Shneider M.M., Dvoryakova E.A., Tokmakova A.D., Shpirt A.M., Kabilov M.R., Obraztsova E.A., Shashkov A.S., Ignatov A.N., Knirel Y.A., Dzhalilov F.S.U., Miroshnikov K.A. Pectobacterium versatile Bacteriophage Possum: A Complex Polysaccharide-Deacetylating Tail Fiber as a Tool for Host Recognition in Pectobacterial Schitoviridae. International Journal of Molecular Sciences 2022. 23(19). 11043. 1–18
Roumiantseva M.L., Vladimirova M.E., Saksaganskaia A.S., Muntyan V.S., Kozlova A.P., Afonin A.M., Baturina O.A., Simarov B.V. Ensifer meliloti L6-AK89, an Effective Inoculant of Medicago lupulina Varieties: Phenotypic and Deep-Genome Screening. Agronomy 2022. 12(4). 766. 1–33
Shanshin D.V., Borisevich S.S., Bondar A.A., Porozov Y.B., Rukhlova E.A., Protopopova E.V., Ushkalenko N.D., Loktev V.B., Chapoval A.I., Ilyichev A.A., Shcherbakov D.N. Can Modern Molecular Modeling Methods Help Find the Area of Potential Vulnerability of Flaviviruses? International Journal of Molecular Sciences 2022. 23(14). 7721. 1–14
Vladimirova M.E., Muntyan V.S., Afonin A.M., Muntyan A.N., Baturina O.A., Dzuybenko E.A., Saksaganskaya A.S., Simarov B.V., Roumiantseva M.L., Kabilov M.R. Complete Genome of Sinorhizobium meliloti AK76, a Symbiont of Wild Diploid Medicago lupulina from the Mugodgary Mountain Region. Microbiology Resource Announcements 2022. 11(3). e01088-21. 1–2

Молекулярная биология и биотехнология

Комарова Е.С., Донцова О.А., Пышный Д.В., Кабилов М.Р., Сергиев П.В. Flow-seq-метод: особенности и применение в изучении бактериальной трансляции. Acta Naturae 2022. 14. 4. 20–37
Komarova E.S., Slesarchuk A.N., Rubtsova M.P., Osterman I.A., Tupikin A.E., Pyshnyi D.V., Dontsova O.A., Kabilov M.R., Sergiev P.V. Flow-Seq Evaluation of Translation Driven by a Set of Natural Escherichia coli 5′-UTR of Variable Length. International Journal of Molecular Sciences 2022. 23(20). 12293. 1–9
Kossinova O.A., Gopanenko A.V., Babaylova E.S., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Malygin A.A., Karpova G.G. Reorganization of the Landscape of Translated mRNAs in NSUN2-Deficient Cells and Specific Features of NSUN2 Target mRNAs. International Journal of Molecular Sciences 2022. 23(17). 9740. 1–18
Balabova D.V., Rudometov A.P., Belenkaya S.V., Belov A.N., Koval A.D., Bondar A.A., Bakulina A.Yu., Rukhlova E.A., Elchaninov V.V., Shcherbakov D.N. Biochemical and technological properties of moose (Alces alces) recombinant chymosin. Vavilov Journal of Genetics and Breeding 2022. 26. 3. 240–249
Tian Y., Babaylova E.S., Gopanenko A.V., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Malygin A.A., Karpova G.G. Changes in the Transcriptome Caused by Mutations in the Ribosomal Protein uS10 Associated with a Predisposition to Colorectal Cancer. International Journal of Molecular Sciences 2022. 23(11). 6174. 1–17
Merkuleva Iu.A., Shcherbakov D.N., Andreeva I.S., Bondar A.A. Screening of Bacillus thuringiensis natural isolates to find promising variants of phosphatidylcholine-specific phospholipase C. AIP Conference Proceedings 2022. 2390. 030056. 1–5
Merkuleva Iu.A., Shcherbakov D.N., Bondar A.A. Development of recombinant phosphatidylcholine-specific phospholipase C from Bacillus thuringiensis. AIP Conference Proceedings 2022. 2390. 030057. 1–5

Геномика эукариот

Kiselev I., Danilova L., Baulina N., Baturina O., Kabilov M., Boyko A., Kulakova O., Favorova O. Genome-wide DNA methylation profiling identifies epigenetic changes in CD4+ and CD14+ cells of multiple sclerosis patients. Multiple Sclerosis and Related Disorders 2022. 60. 103714. 1–8
Kiselev I.S., Kulakova O.G., Danilova L.V., Baturina O.A., Kabilov M.R., Popova E.V., Boyko A.N., Favorova O.O. Genome-Wide Analysis of DNA Methylation in Cd4+ T Lymphocytes of Patients with Primary Progressive Multiple Sclerosis Indicates Involvement of This Epigenetic Process in the Disease Immunopathogenesis. Molecular Biology 2022. 56. 3. 417–423
Lomakin Y.A., Zvyagin I.V., Ovchinnikova L.A., Kabilov M.R., Staroverov D.B., Mikelov A., Tupikin A.E., Zakharova M.Y., Bykova N.A., Mukhina V.S., Favorov A.V., Ivanova M., Simaniv T., Rubtsov Y.P., Chudakov D.M., Zakharova M.N., Illarioshkin S.N., Belogurov A.A., Gabibov A.G. Deconvolution of B cell receptor repertoire in multiple sclerosis patients revealed a delay in tBreg maturation. Frontiers in Immunology 2022. 13. 803229. 1–15
Romanenko S.A., Prokopov D.Y., Proskuryakova A.A., Davletshina G.I., Tupikin A.E., Kasai F., Ferguson-Smith M.A., Trifonov V.A. The Cytogenetic Map of the Nile Crocodile (Crocodylus niloticus, Crocodylidae, Reptilia) with Fluorescence In Situ Localization of Major Repetitive DNAs. International Journal of Molecular Sciences 2022. 23(21). 13063. 1–14
Sinitsky M., Sinitskaya A., Shishkova D., Tupikin A., Asanov M., Khutornaya M., Kabilov M., Ponasenko A. Identification of Key Genes and Pathways in Genotoxic Stress Induced Endothelial Dysfunction: Results of Whole Transcriptome Sequencing. Biomedicines 2022. 10(9). 2067. 1–15
Tamkovich S., Tupikin A., Kozyakov A., Laktionov P. Size and Methylation Index of Cell-Free and Cell-Surface-Bound DNA in Blood of Breast Cancer Patients in the Contest of Liquid Biopsy. International Journal of Molecular Sciences 2022. 23(16). 8919. 1–12
Tutanov O., Shtam T., Grigor’eva A., Tupikin A., Tsentalovich Y., Tamkovich S. Blood Plasma Exosomes Contain Circulating DNA in Their Crown. Diagnostics 2022. 12(4). 854. 1–14
Vlasenko A.V., Vlasenko V.A., Kabilov M.R. A new species of Diacheopsis from Russia. Phytotaxa 2022. 541. 2. 193–200
Ломакин Я.А., Овчинникова Л.А., Захарова М.Н., Иванова М.В., Симанив Т.О., Кабилов М.Р., Быкова Н.А., Мухина В.С., Каминская А.Н., Тупикин А.Е., Захарова М.Ю., Фаворов А.В., Иллариошкин С.Н., Белогуров А.А., Габибов А.Г. Смещение репертуара генов зародышевой линии В-клеточных рецепторов при рассеянном склерозе. Acta Naturae 2022. 14. 4. 84–93

Метагеномика

Naumova N.B., Alikina T.Y., Zolotova N.S., Konev A.V., Pleshakova V.I., Lescheva N.A., Kabilov M.R. Bacillus-Based Probiotic Treatment Modified Bacteriobiome Diversity in Duck Feces. Agriculture (Basel). 2021, V. 11, N 5, P. 406
Grigor’eva I., Romanova T., Naumova N.B., Alikina T.Y., Kuznetsov A., Kabilov M.R. Gut Microbiome in a Russian Cohort of Pre- and Post-Cholecystectomy Female Patients. J Pers Med.. 2021, V. 11, N 4, P. 294
Kozhieva M., Naumova N.B., Alikina T.Y., Boyko A., Vlassov V.V., Kabilov M.R. The Core of Gut Life: Firmicutes Profile in Patients with Relapsing-Remitting Multiple Sclerosis. Life-Basel. 2021, V. 11, N 1, P. 55
Noskov Y.A., Kabilov M.R., Polenogova O.V., Yurchenko Y.A., Belevich O.E., Yaroslavtseva O.N., Alikina T.Y., Byvaltsev A.M., Rotskaya U.N., Morozova V.V., Glupov V.V., Kryukov V.Yu. A Neurotoxic Insecticide Promotes Fungal Infection in Aedes aegypti Larvae by Altering the Bacterial Community. Microbial Ecology. 2021, V. 81, N 2, P. 493-505
Butina T.V., Bukin Y.S., Petrushin I.S., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Belikov S.I. Extended Evaluation of Viral Diversity in Lake Baikal through Metagenomics. Microorganisms. 2021, V. 9, N 4, P. 760
Galachyants A.D., Krasnopeev A.Y., Podlesnaya G.V., Potapov S.A., Sukhanova E.V., Tikhonova I.V., Zimens E.A., Kabilov M.R., Zhuchenko N.A., Gorshkova A.S., Suslova M.Yu., Belykh O.I. Diversity of Aerobic Anoxygenic Phototrophs and Rhodopsin-Containing Bacteria in the Surface Microlayer, Water Column and Epilithic Biofilms of Lake Baikal. Microorganisms. 2021, V. 9, N 4, P. 842
Tyurin M., Kabilov M.R., Smirnova N., Tomilova O.G., Yaroslavtseva O., Alikina T.Y., Glupov V.V., Kryukov V.Yu. Can Potato Plants Be Colonized with the Fungi Metarhizium and Beauveria under Their Natural Load in Agrosystems?. Microorganisms. 2021, V. 9, N 7, P. 1373
Polenogova O.V., Noskov Y.A., Yaroslavtseva O.N., Kryukova N.A., Alikina T.Y., Klementeva T.N., Andrejeva J., Khodyrev V.P., Kabilov M.R., Kryukov V.Yu., Glupov V.V. Influence of Bacillus thuringiensis and avermectins on gut physiology and microbiota in Colorado potato beetle: Impact of enterobacteria on susceptibility to insecticides. PloS ONE. 2021, V. 16, N 3, e0248704
Kryukov V.Yu., Rotskaya U., Yaroslavtseva O., Polenogova O., Kryukova N., Akhanaev Y., Krivopalov A., Alikina T.Y., Vorontsova Y.L., Slepneva I., Kabilov M.R., Glupov V.V. Fungus Metarhizium robertsii and neurotoxic insecticide affect gut immunity and microbiota in Colorado potato beetles. Scientific Reports. 2021, V. 11, N 1, P. 1299
Melekhina E.N., Belykh E.S., Markarova M.Yu., Taskaeva A.A., Rasova E.E., Baturina O.A., Kabilov M.R., Velegzhaninov I.O. Soil microbiota and microarthropod communities in oil contaminated sites in the European Subarctic. Scientific Reports. 2021, V. 11, N 1, P. 19620
Naumova N.B., Belanov I., Alikina T.Y., Kabilov M.R. Soil microbiome after nine years of fly ash dump spontaneous revegetation. Soil Res.. 2021, , ,
Naumova N.B., Belanov I.P., Alikina T.Y., Kabilov M.R. Undisturbed Soil Pedon under Birch Forest: Characterization of Microbiome in Genetic Horizons. Soil Syst.. 2021, V. 5, N 1, P. 14
Dubovskiy I.M., Grizanova E.V., Tereshchenko D., Krytsyna T.I., Alikina T.Y., Kalmykova G., Kabilov M.R., Coates C.J. Bacillus thuringiensis Spores and Cry3A Toxins Act Synergistically to Expedite Colorado Potato Beetle Mortality. Toxins. 2021, V. 13, N 11, P. 746
Кашинская Е.Н., Симонов Е.П., Извекова Г.И., Батурина О.А., Соловьев М.М. Изменчивость состава микробиоты желудочно-кишечного тракта обыкновенного окуня perca fluviatilis и серебряного карася carassius gibelio в течение вегетационного сезона. Вопросы ихтиологии. 2021, Т. 61, № 6, С. 713-729
Кравцова Л.С., Перетолчина Т.Е., Трибой Т.И., Небесных И.А., Купчинский А.Б., Тупикин А.Е., Кабилов М.Р. Исследование разнообразия гидробионтов лиственничного залива озера Байкал с использованием ДНК-метабаркодинга. Генетика. 2021, Т. 57, № 4, С. 445-453
Колмакова О.В., Трусова М.Ю., Батурина О.А., Кабилов М.Р. Бактерии оз. Пясино и прилегающих рек после аварийного разлива дизельного топлива в 2020 г.. Сибирский экологический журнал. 2021, Т. 28, № 4, с. 450-461

Геномика бактерий и вирусов

Evseev P.V., Lukianova A., Sykilinda N., Gorshkova A., Bondar A.A., Shneider M., Kabilov M.R., Drucker V., Miroshnikov K. Pseudomonas Phage MD8: Genetic Mosaicism and Challenges of Taxonomic Classification of Lambdoid Bacteriophages. Int. J. Mol. Sci.. 2021, V. 22, N 19, P. 10350
Muntyan V.S., Afonin A.M., Vladimirova M.E., Saksaganskaya A.S., Gribchenko E.S., Baturina O.A., Roumiantseva M.L. Complete Genome Sequence of Sinorhizobium meliloti S35m, a Salt-Tolerant Isolate from Alfalfa Rhizosphere in Soil Native to the Caucasus Region. Microbiol. Resour. Ann.. 2021, V. 10, N 11, e01417-20

Молекулярная биология и биотехнология

Gopanenko A.V., Kolobova A.V., Meschaninova M.I., Venyaminova A.G., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Malygin A.A., Karpova G.G. Knockdown of the mRNA encoding the ribosomal protein eL38 in mammalian cells causes a substantial reorganization of genomic transcription. Biochimie. 2021, V. 184, , P. 132-142
Kudriaeva A.A., Livneh I., Baranov M.S., Ziganshin R.H., Tupikin A.E., Zaitseva S.O., Kabilov M.R., Ciechanover A., Belogurov A.A. In-depth characterization of ubiquitin turnover in mammalian cells by fluorescence tracking. Cell Chem Biol.. 2021, , , S2451-9456(21)00094-5
Gopanenko A.V., Kolobova A.V., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Malygin A.A., Karpova G.G. Knockdown of the Ribosomal Protein eL38 in HEK293 Cells Changes the Translational Efficiency of Specific Genes. Int. J. Mol. Sci.. 2021, V. 22, N 9, P. 4531
Babaylova E.S., Gopanenko A.V., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Malygin A.A., Karpova G.G. Deficiency of the ribosomal protein uL5 leads to significant re-arrangements of the transcriptional and translational land-scapes in mammalian cells. Int. J. Mol. Sci.. 2021, V. 22, N 24, P. 13485
Komarevtsev S.K., Evseev P.V., Shneider M.M., Popova E.A., Tupikin A.E., Stepanenko V.N., Kabilov M.R., Shabunin S.V., Osmolovskiy A.A., Miroshnikov K.A. Gene Analysis, Cloning, and Heterologous Expression of Protease from a Micromycete Aspergillus ochraceus Capable of Activating Protein C of Blood Plasma. Microorganisms. 2021, V. 9, N 9, P. 1936

Геномика эукариот

Bryzgunova O.E., Bondar A.A., Ruzankin P., Laktionov P., Tarasenko A., Kurilschikov A.M., Epifanov R., Zaripov M., Kabilov M.R., Laktionov P.P. Locus-Specific Methylation of GSTP1, RNF219, and KIAA1539 Genes with Single Molecule Resolution in Cell-Free DNA from Healthy Donors and Prostate Tumor Patients: Application in Diagnostics. Cancers. 2021, V. 13, N 24, P. 6234
Danilchenko V.Yu., Zytsar M.V., Maslova E.A., Bady-Khoo M.S., Barashkov N.A., Morozov I.V., Bondar A.A., Posukh O.L. Different Rates of the SLC26A4-Related Hearing Loss in Two Indigenous Peoples of Southern Siberia (Russia). Diagnostics. 2021, V. 11, N 12, P. 2378
Barashkov N.A., Konovalov F.A., Borisova T.V., Teryutin F.M., Solovyev A.V., Pshennikova V.G., Sapojnikova N.V., Vychuzhina L.S., Romanov G.P., Gotovtsev N.N., Morozov I.V., Bondar A.A., Platonov F.A., Burtseva T.E., Khusnutdinova E.K., Posukh O.L., Fedorova S.A. Autosomal recessive cataract (CTRCT18) in the Yakut population isolate (Eastern Siberia, Russia): a novel founder variant c.1621C>T (p.Gln541*) in the FYCO1 gene. Eur J Hum Genet. 2021, P. 1-12

Метагеномика

Лаврентьева Е.В., Эрдынеева Е.Б., Банзаракцаева Т.Г., Коцюрбенко О.Р., Батурина О.А., Хахинов В.В., Козырева Л.П. Разнообразие прокариот в биотопах соленого щелочного озера Гуджирганское (Баргузинская долина, Бурятия). Микробиология. 2020. Т. 89. N 3. C. 356–366
Рогозин Д.Ю., Бульхин А.О., Зыков В.В., Иванова Е.А., Дарьин А.В., Калугин И.А., Батурина О.А., Кабилов М.Р. Длинноцепочечные алкеноны в соленых меромиктических озерах Северо-Минусинской котловины (юг Сибири): первые сведения и возможная связь с динамикой уровня. Сибирский Экологический Журнал. 2020. N 6. C. 768–782
Kryukov V.Yu., Kosman E., Tomilova O., Polenogova O., Rotskaya U., Tyurin M., Alikina T., Yaroslavtseva O., Kabilov M., Glupov V. Interplay between fungal infection and bacterial associates in the wax moth Galleria mellonella under different temperature conditions. Journal of Fungi. 2020. Т. 6. N 3. P. 170
Lipko I.A., Krasnopeev A.Y., Tikhonova I.V., Timoshkin O.A., Kabilov M.R., Belykh O.I. Genetic diversity of Actinobacteria inhabiting water and sponges of Lake Baikal. Limnology and Freshwater Biology. 2020. N 4. P. 998–999
Mincheva Е.V., Peretolchina T.E., Bukin Yu.S., Kabilov M.R., Tupikin A.E., Kravtsova L.S., Kupchinsky A.B., Sherbakov D.Yu. The composition of the communities of green algae and microeukaryotes at the sites of Lake Baikal contrasting in anthropogenic pressure. Limnology and Freshwater Biology. 2020. N 4. P. 729–730
Naumova N., Alikina T., Tupikin A., Kalmykova А., Soldatova G., Vlassov V., Kabilov M. Human gut microbiome response to short-term Bifidobacterium-based probiotic treatment. Indian J Microbiol. 2020. Т. 60. N 4. P. 451–457
Noskov Y.A., Kabilov M.R., Polenogova O.V., Yurchenko Y.A., Belevich O.E., Yaroslavtseva O.N., Alikina T.Y., Byvaltsev A.M., Rotskaya U.N., Morozova V.V., Glupov V.V., Kryukov V.Y. A neurotoxic insecticide promotes fungal infection in Aedes aegypti larvae by altering the bacterial community. Microb Ecol. 2020. Т. 81. P. 493–505
Polyakova M.S., Mincheva Е.V., Pudovkina Т.А., Kabilov M.R., Tupikin A.E., Ishchenko А.А., Kurakov A.V., Sherbakov D.Yu. The first data on fungi and fungus-like organisms in Lake Baikal. Limnology and Freshwater Biology. 2020. N 4. P. 741–742
Potapov S.A., Tikhonova I.V., Krasnopeev A.Yu., Kabilov M.R., Tupikin A.E., Chebunina N.S., Zhuchenko N.A., Belykh O.I. Characteristics of the viromes in the pelagic zone of Lake Baikal. Limnology and Freshwater Biology. 2020. N 4. P. 1013–1014
Sorokovikova E., Belykh O., Krasnopeev A., Potapov S., Tikhonova I., Khanaev I., Kabilov M., Baturina O., Podlesnaya G., Timoshkin O. First data on cyanobacterial biodiversity in benthic biofilms during mass mortality of endemic sponges in Lake Baikal. Journal of Great Lakes Research. 2020. Т. 46. N 1. P. 75–84

Геномика бактерий и вирусов

Борисова Т.В., Готовцев Н.Н., Барашков Н.А., Пак М.В., Алексеева М.П., Иннокентьева Н.Н., Морозов И.В., Бондарь А.А., Лоскутова К.С., Соловьев А.В., Пшенникова В.Г., Рафаилов А.М., Леханова С.Н., Федорова С.А. Филогенетический анализ штаммов Helicobacter pylori, циркулирующих в Якутии, по данным трех генов домашнего хозяйства atpA, mutY, ppa. Медицинская Генетика. 2020. T. 19. N 7. C. 105–106
Shneider M.M., Lukianova A.A., Evseev P.V., Shpirt A.M., Kabilov M.R., Tokmakova A.D., Miroshnikov K.K., Obraztsova E.A., Baturina O.A., Shashkov A.S., Ignatov A.N., Knirel Yu.A., Miroshnikov K.A. Autographivirinae bacteriophage Arno 160 Infects Pectobacterium carotovorum via depolymerization of the bacterial O-polysaccharide. International Journal of Molecular Sciences. 2020. Т. 21. N 9. P. 3170

Молекулярная биология и биотехнология

Беленькая С.В., Бондарь А.А., Кургина Т.А., Ельчанинов В.В., Бакулина А.Ю., Рухлова Е.А., Лаврик О.И., Ильичев А.А., Щербаков Д.Н. Идентификация гена химозина алтайского марала [cervus elaphus sibiricus (severtzov, 1873)], наработка его рекомбинантного аналога в прокариотической системе экспрессии и анализ некоторых биохимических свойств полученного фермента. Биохимия. 2020. Т. 85. N 7. C. 916–928
Великанова Е.А., Кутихин А.Г., Матвеева В.Г., Тупикин А.Е., Кабилов М.Р., Антонова Л.В. Сравнение профиля генной экспрессии колониеформирующих эндотелиальных клеток из периферической крови человека и эндотелиальных клеток коронарной артерии. Комплексные проблемы сердечно-сосудистых заболеваний. 2020. Т. 9. N 2. C. 74–81
Babaylova E.S., Gopanenko A.V., Bulygin K.N., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Malygin A.A., Karpova G.G. mRNA regions where 80S ribosomes pause during translation elongation in vivo interact with protein uS19, a component of the decoding site. Nucleic Acids Res. 2020. Т. 48. N 2. P. 912–923
Babaylova E.S., Kolobova A.V., Gopanenko A.V., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Malygin A.A., Karpova G.G. The human ribosomal protein eL29 binds in vivo to the cognate mRNA by interacting with its coding sequence, as revealed from in-cell cross-linking data. Biochimie. 2020. Т. 177. P. 68–77
Davydova A., Krasitskaya V., Vorobjev P., Timoshenko V., Tupikin A., Kabilov M., Frank L., Venyaminova A., Vorobyeva M. Reporter-recruiting bifunctional aptasensor for bioluminescent analytical assays. RSC Adv. 2020. Т. 10. N 54. P. 32393–32399
Gopanenko A.V., Kolobova A.V., Meschaninova M.I., Venyaminova A.G., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Malygin A.A., Karpova G.G. Knockdown of the ribosomal protein eL29 in mammalian cells leads to significant changes in gene expression at the transcription level. Cells. 2020. Т. 9. N 5. P. 1228
Gopanenko A.V., Malygin A.A., Kossinova О.A., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Karpova G.G. Degenerate consensus sequences in the 3′-untranslated regions of cellular mRNAs as specific motifs potentially involved in the YB-1-mediated packaging of these mRNAs. Biochimie. 2020. Т. 170. P. 152–162
Krasitskaya V.V., Goncharova N.S., Biriukov V.V., Bashmakova E.E., Kabilov M.R., Baykov I.K., Sokolov A.E., Frank L.A. The Ca2+-regulated photoprotein obelin as a tool for SELEX monitoring and DNA aptamer affinity evaluation. Photochemistry and Photobiology. 2020. Т. 96. N 5. P. 1041–1046
Kutikhin A.G., Tupikin A.E., Matveeva V.G., Shishkova D.K., Antonova L.V., Kabilov M.R., Velikanova E.A. Human peripheral blood-derived endothelial colony-forming cells are highly similar to mature vascular endothelial cells yet demonstrate a transitional transcriptomic signature. Cells. 2020. Т. 9. N 4. P. 876
Osterman I.A., Chervontseva Z.S., Evfratov S.A., Sorokina A.V., Rodin V.A., Rubtsova M.P., Komarova E.S., Zatsepin T.S., Kabilov M.R., Bogdanov A.A., Gelfand M.S., Dontsova O.A., Sergiev P.V. Translation at first sight: the influence of leading codons. Nucleic Acids Research. 2020. Т. 48. N 12. P. 6931–6942
Terekhov S.S., Eliseev I.E., Ovchinnikova L.A., Kabilov M.R., Prjibelski A.D., Tupikin A.E., Smirnov I.V., Belogurov A.A., Severinov K.V., Lomakin Y.A., Altman S., Gabibov A.G. Liquid drop of DNA libraries reveals total genome information. PNAS. 2020. Т. 117. N 44. P. 27300–27306

Геномика эукариот

Dryomov S.V., Starikovskaya E.B., Nazhmidenova A.M., Morozov I.V., Sukernik R.I. Genetic legacy of cultures indigenous to the Northeast Asian coast in mitochondrial genomes of nearly extinct maritime tribes. BMC Evolutionary Biology. 2020. Т. 20. N 83. P. 1–8
Nuzhdina N.S., Dorogina O.V., Bondar A.A. Chloroplast and nuclear ribosomal DNA variation in two geographically and ecologically overlapping Hedysarum species. Annales Botanici Fennici. 2020. Т.57. N 4–6. P. 299–308
Vasilyeva G., Bondar A., Goroshkevich S. What does a mixed population of Pinus sibirica and P. pumila from the southern Baikal region suggest about the structure of their hybrid zone? Eur J Forest Res. 2020. Т. 139. N 2. P. 311–319
Zytsar M.V., Bady-Khoo M.S., Danilchenko V.Yu., Maslova E.A., Barashkov N.A., Morozov I.V., Bondar A.A., Posukh O.L. High rates of three common GJB2 mutations c.516G>C, c.-23+1G>A, c.235delC in deaf patients from southern Siberia are due to the founder effect. Genes. 2020. Т. 11. N 7. P. 833

Метагеномика

Kozhieva M., Naumova N.B., Alikina T.Y., Boyko A.N., Vlassov V.V., Kabilov M.R. Primary progressive multiple sclerosis in a Russian cohort: relationship with gut bacterial diversity. BMC Microbiol. 2019. V. 19. N 1. P. 309
Polenogova O.V., Kabilov M.R., Tyurin M.V., Rotskaya U.N., Krivopalov A.V., Morozova V.V., Mozhaitseva K., Kryukova N.A., Alikina T.Y., Kryukov V.Yu., Glupov V.V. Parasitoid envenomation alters the Galleria mellonella midgut microbiota and immunity, thereby promoting fungal infection. Scientific Reports. 2019. V. 9. № 1. P. 4012
Kryukov Y., Kabilov M.R., Smirnova N., Tomilova O.G., Tyurin M.V., Akhanaev Y.B., Polenogova O.V., Danilov V.P., Zhangissina S.K., Alikina T.Y., Yaroslavtseva O.N., Glupov V.V. Bacterial decomposition of insects post-Metarhizium infection: Possible influence on plant growth. Fungal biology. 2019. V. 123. P. 927-935
Naumova N.B., Savenkov O.A., Alikina T.Y., Kabilov M.R. Rhizosphere Bacteriobiome of the Husk Tomato Grown in the Open Field in West Siberia. Agriculture. 2019. V. 65. N 4. С. 12-16
Potapov S.A., Tikhonova I.V., Krasnopeev A.Yu., Kabilov M.R., Tupikin A.E., Chebunina N.S., Zhuchenko N.A., Belykh O.I. Metagenomic Analysis of Virioplankton from the Pelagic Zone of Lake Baikal. Viruses. 2019. V. 11. P. 991
Butina T.V., Bukin Y.S., Krasnopeev A.S., Belykh O.I., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Sakirko M.V., Belikov S.I. Estimate of the diversity of viral and bacterial assemblage in the coastal water of Lake Baikal. FEMS Microbiol. Lett. 2019. V. 366. N 9. pii: fnz094
Butina T.V., Bukin Y.S., Khanaev I.V., Kravtsova L.S., Maikova O.O., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Belikov S.I. Metagenomic analysis of viral communities in diseased Baikal sponge Lubomirskia baikalensis. Limnology and Freshwater Biology. 2019. N 1. P. 155-162
Mincheva E.V., Peretolchina T.E., Kravtsova L.S., Tupikin A.E., Pudovkina T.A., Ananyeva I.A., Triboy T.I., Voylo M.A., Bukin Yu.S. Hidden diversity of micro-eukaryotes in Lake Baikal: a metagenomic approach150. Limnology and Freshwater Biology. 2019. N 1. P. 150–154
Zakharenko А.S., Galachyants Y.P., Morozov I.V., Ivanov V.G., Pimenov N.V., Krasnopeev A.Y., Zemskaya T.I. Bacterial Communities in Areas of Oil and Methane Seeps in Pelagic of Lake Baikal. Microbial Ecology. 2019. V. 78. N 21. P. 269-285
Bukin Y.S., Galachyants Y.P., Morozov I.V., Bukin S.V., Захаренко А.S., Zemskaya T.I. The effect of 16S rRNA region choice on bacterial community metabarcoding results. Sci Data. 2019. V. 6. P. 190007
Lavrentyeva E.V., Banzaraktsaeva T.G., Radnagurueva A.A., Buryukhaev S.P., Dambaev V.B., Baturina O.A., Kozyreva L.P., Barkhutova D.D. Microbial Community of Umkhei Thermal Lake (Baikal Rift Zone) in the Groundwater Discharge Zone. Contemp Probl Ecol. 2019. V. 12. N 6. P. 584-593
Лаврентьева Е.В., Банзаракцаева Т.Г., Раднагуруева А.А., Бурюхаев С.П., Дамбаев В.Б., Батурина О.А., Козырева Л.П., Бархутова Д.Д. Микробное сообщество термального озера умхей (Байкальская рифтовая зона) в зоне разгрузки подземных вод. Сибирский экологический журнал. 2019. Т. 26. № 6. С. 715-726
Дрюккер В.В., Белых О.И., Горшкова А.С., Бондарь А.А., Сыкилинда Н.Н. Автохтонные бактериофаги в структуре «микробной петли» различных биотопов озера Байкал. Сибирский экологический журнал. 2019. Т. 26. № 2. C. 177–191

Геномика бактерий и вирусов

Morozova V.V., Bokovaya O.V., Kozlova Y.N., Kurilschikov A.M., Babkin I.V., Tupikin A.E., Bondar A.A., Ryabchikova E.I., Brayanskaya A., Peltek S.E., Tikunova N.V. A novel thermophilic Aeribacillus bacteriophage AP45 isolated from the Valley of Geysers, Kamchatka, Russia. Extremophiles. 2019. P. 1-14
Chirak E.R., Kimeklis A.K., Karasev E.S., Kopat V.V., Safronova V.I., Belimov A.A., Aksenova T.S., Kabilov M.R., Provorov N.A., Andronov E.E. Search for Ancestral Features in Genomes of Rhizobium leguminosarum bv. viciae Strains Isolated from the Relict Legume Vavilovia formosa. Genes. 2019. V. 10. P. 990
Sharshov K., Kurskaya O., Sobolev I., Leonov S., Kabilov M.R., Alikina T.Y., Alekseev A., Derko A., Yushkov Y., Saito T., Uchida Y., Mine J., Irza V., Shestopalov A. First detection of a G1-like H9N2 virus in Russia, 2018. Korean Journal of Veterinary Research. 2019. V. 59. N 1. P. 37-42
Glushchenko A.V., Alikina T.Y., Yurchenko K.S., Shekunov E.V., Gulyaeva M.A., Matsuno K., Okamatsu M., Kabilov M.R., Shestopalov A.M. Nearly Complete Genome Sequence of a Newcastle Disease Virus Strain Isolated from a Wild Garganey (Spatula querquedula) in Russia. Microbiol. Resour. Ann. 2019. V. 8. N 50. e01072-19
Sharshov K., Mine J., Sobolev I., Kurskaya O., Dubovitskiy N., Kabilov M.R., Alikina T.Y., Nakayama M., Tsunekuni R., Derko A., Prokopyeva E., Alekseev A., Shchelkanov M., Druzyaka A., Gadzhiev A., Uchida Y., Shestopalov A., Saito T. Characterization and Phylodynamics of Reassortant H12Nx Viruses in Northern Eurasia. Microorganisms. 2019. V. 7. P. 643
Muntyan V.S., Baturina O.A., Afonin A.M., Cherkasova M.E., Laktionov Yu.V., Saksaganskaya A.S., Kabilov M.R., Roumiantseva M.L. Draft Genome Sequence of Sinorhizobium meliloti AK555. Microbiol. Resour. Ann. 2019. V. 8. N 2. e01567-18
Baturina O.A., Muntyan V.S., Afonin A.M., Cherkasova M.E., Simarov B.V., Kabilov M.R., Roumiantseva M.L. Draft Genome Sequence of Sinorhizobium meliloti Strain CXM1-105. Microbiol. Resour. Ann. 2019. V. 8. N 2. e01621-18
Карасев Е.С., Андронов Е.Е., Аксенова Т.С., Чижевская Е.П., Тупикин А.Е., Проворов Н.А. Эволюции ризобий козлятника (Neorhizobium galegae): анализ полиморфизма генов фиксации азота и развития клубеньков. Генетика. 2019. Т. 55. № 2. C. 234–238

Молекулярная биология и биотехнология

Vorobyev P.E., Epanchintseva A.V., Lomzov A.A., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Pyshnaya I.A., Pyshnyi D.V. DNA Binding to Gold Nanoparticles through the Prism of Molecular Selection: Sequence – Affinity Relation. Langmuir. 2019. V. 35. N 24. P. 7916-7928
Ochkasova A., Kabilov M.R., Karpova G.G., Graifer D.M. Exploring the Interaction of Human Ribosomal Protein uS3 with Single-Stranded DNAs Having Different Sequences. Биоорганическая химия. 2019. V. 45. N 6. P. 619–624
Krasitskaya V.V., Timoshenko V.V., Abroskina M.V., Vorobjeva M.A., Ilminskaya A.A., Kabilov M.R., Prokopenko S.V., Nevinsky G.A., Venyaminova A.G., Frank L.A. Bioluminescent aptamer-based sandwich-type assay of anti-myelin basic protein autoantibodies associated with multiple sclerosis. Anal Chim Acta. 2019. V. 1064. P. 112-118
Davydova A.S., Vorobjeva M.A., Bashmakova E.E., Vorobyev P.E., Krasheninina O.A., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Krasitskaya V.V., Frank LA, Venyaminova A.G. Development and characterization of novel 2′-F-RNA aptamers specific to human total and glycated hemoglobins. Anal Biochem. 2019. V. 570. P. 43–50
Очкасова А.С., Кабилов М.Р., Карпова Г.Г., Грайфер Д.М. Изучение взаимодействия рибосомного белка us3 человека с одноцепочечными ДНК с разными последовательностями. Биоорганическая химия. 2019. Т. 45. № 6.
Давыдова А.С., Крашенинина О.А., Тупикин А.Е., Кабилов М.Р., Веньяминова А.Г., Воробьева М.А. Cинтез ДНК-библиотек для in vitro-селекции и анализ равномерности их состава. Биоорганическая химия. 2019. T. 45. № 6.

Геномика эукариот

Baturina O.A., Tupikin A.E., Goroshkevich S.N., Petrova E.A., Kabilov M.R. The complete chloroplast genome sequences of Pinus sibirica Du Tour. Mitochondrial DNA Part B. 2019. V. 4. N 1. P. 286-287
Tamkovich S.N., Grigoryeva A.E., Eremina A., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Chernykh V., Vlassov V.V., Ryabchikova E.I. What information can be obtained from the tears of a patient with primary open angle glaucoma?. Clin. Chim. Acta. 2019. V. 495. P. 529-537
Kichigin I.G., Lisachov A.P., Giovannotti M., Makunin A.I., Kabilov M.R., O’Brien P.C. M., Ferguson‑Smith M.A., Graphodatsky A.S., Trifonov V.A. First report on B chromosome content in a reptilian species: the case of Anolis carolinensis. Mol. Genet. Genomics. 2019. V. 294. P. 13–21

Другие направления

Nilsson L.M., Zhang L., Bondar A.A., Svensson D., Wernerson A., Brismar H., Scott L., Aperia A. Prompt apoptotic response to high glucose in SGLT-expressing renal cells. Am J Physiol Renal Physiol. 2019. V. 316. N 5. F1078-F1089
Katkova L.E., Baturina G.S., Bondar A.A., Jagirdar R.M., Hatzoglou C., Gourgoulianis K.I., Solenov E.I., Zarogiannis S.G. Benign pleural mesothelial cells have higher osmotic water permeability than malignant pleural mesothelioma cells and differentially respond to hyperosmolality. Cell Physiol Biochem. 2019. V. 52. P. 869-878
Posukh O.L., Zytsar M.V., Bady-Khoo M.S., Danilchenko V.Yu., Maslova E.A., Barashkov N.A., Bondar A.A., Morozov I.V., Maximov V.N., Voevoda M.I. Unique Mutational Spectrum of the GJB2 Gene and its Pathogenic Contribution to Deafness in the Tyva Republic (Southern Siberia, Russia): a High Prevalence of Rare Variant c.516G>C (p.Trp172Cys) among Tuvinians. Genes. 2019. V.10. N 6. pii: E429
Pshennikova V.G., Teryutin F.M., Bondar A.A., Morozov I.V., Khusnutdinova E.K., Posukh O.L., Burtseva T.E., Odland J.O., Fedorova S.A. A rare case of Waardenburg syndrome with unilateral hearing loss caused by nonsense variant c.772C>T (p.Arg259*) in the MITF gene in Yakut patient from the Eastern Siberia (Sakha Republic, Russia) International Journal of Circumpolar Health. Int J Circumpolar Health. 2019. V. 78. N 1. P. 1630219
Pshennikova V.G., Barashkov N.A., Romanov G.P., Teryutin F.M., Solovyev A.V., Gotovtsev N.N., Nikanorova A.A., Nakhodkin S.S., Sazonov N.N., Morozov I.V., Bondar A.A., Dzhemileva L.U., Khusnutdinova E.K., Posukh O.L., Fedorova S.A. Comparison of Predictive in silico Tools on Missense Variants in GJB2, GJB6 and GJB3 Genes Associated with Autosomal Recessive Deafness 1A (DFNB1A). ScientificWorldJournal. 2019. V. 2019. N 20. P. 5198931
Батурина О.А., Черноносов А.А., Коваль В.В., Морозов И.В. Оценка степени проявления фенилкетонурии, обусловленной гомозиготной мутацией p.R155H, при помощи массспектрометрического анализа метаболитов крови. Acta Naturae. 2019. Т. 11. № 2 (41). С. 42-46
Агафонов А.В., Асбаганов С.В., Шабанова (Кобозева)Е.В., Морозов И.В., Бондарь А.А. Геномная конституция и дифференциация субгеномов эндемичных cибирских и дальневосточных видов рода Elymus (Poaceae) по данным секвенирования ядерного гена waxy. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2019. Т. 23. № 7. С. 817-826
Пшенникова В.Г., Романов Г.П., Николаева Т.М., Терютин Ф.М., Борисова Т.В., Комарьков И.Ф., Антонец А.В., Соловьев А.В., Кларов Л.А., Бондарь А.А., Морозов И.В., Посух О.Л., Хуснутдинова Э.К., Федорова С.А., Барашков Н.А. Новая нонсенс-мутация с.1121G>A (p.Trp374*) гена CLIC5 - основная причина ювенильной аутосомно-рецессивной формы глухоты (DFNB103), очаги накопления которой обнаружены в арктических районах Якутии. Медицинская генетика. 2019. Т. 18. №10. С.36-48

Potapov S., Belykh O., Krasnopeev A.,Gladkikh A., Kabilov M.R., Tupikin A.E.,Butina T. Assessing the diversity of the g23 gene of T4-like bacteriophages from Lake Baikal with high-throughput sequencing. FEMS Microbiol. Lett.. 2018. V. 365. N 3. P. 1-7
Marchenkov A.M., Petrova D.V., Morozov A.A., Zakharova Y.R., Grachev M.A., Bondar A.A. A family of silicon transporter structural genes in a pennate diatom Synedra ulna subsp. danica (Kütz.) Skabitsch. PloS ONE. 2018. V. 13. N 8. e0203161
Morozova V.V., Kozlova Y.N., Shedko E., Babkin I.V., Kurilschikov A.M., Bokovaya O.V., Bardasheva A., Yunusova A.Y., Tikunov A., Tupikin A.E., Ushakova T.A., Ryabchikova E.I., Tikunova N.V. Isolation and characterization of a group of new Proteus bacteriophages. Archives of Virology. 2018. V. 163. N 8. P. 2189-2197
Igolkina А.А., Grekhov G.A., Pershina E.V.,Samosorova G.G., Leunova V.M.,Semenova A.N., Baturina O.A., Kabilov M.R., Andronov E.E. Identifying components of mixed and contaminated soil samples by detecting specific signatures of control 16S rRNA libraries. Ecological Indicators. 2018. V. 94. N 1. P. 446-453
Zytsar M.V., Barashkov N.A., Bady-Khoo M.S., Shubina-Olejnik O.A., Danilenko N.G., Bondar A.A., Morozov I.V., Solovyev A.V., Danilchenko V.Yu., Maximov V.N.,Posukh O.V. Updated carrier rates for c.35delG (GJB2) associated with hearing loss in Russia and common c.35delG haplotypes in Siberia. BMC medical genetics. 2018. V. 19. P. 1-9
Liebmann T., Fritz N., Kruusmagi M.,Westin L., Bernhem K., Bondar A.A.,Aperia A., Brismar H. Regulation of Neuronal Na,K-ATPase by Extracellular Scaffolding Proteins. Int. J. Mol. Sci.. 2018. V. 19. N 8. P. 2-15
Bashmakova E.E., Krasitskaya V.V., Bondar A.A., Eremina E.N., Slepov E.V.,Zukov R.A., Frank L.A. Bioluminescent SNP genotyping technique: Development and application for detection of melanocortin 1 receptor gene polymorphisms. Talanta. 2018. V. 189. P. 111-115
Barashkov N.A., Klarov L.A., Teryutin F.M.,Solovyev A.V., Pshennikova V.G.,Konnikova E.E., Romanov G.P., Tobokhov A.V., Morozov I.V., Bondar A.A., Posukh O.L., Dzhemileva L.U., Tomsky MI9,Khusnutdinova E.K., Fedorova S.A. A novel pathogenic variant c.975G>A (p.Trp325*) in the POU3F4 gene in Yakut family (Eastern Siberia, Russia) with the X-linked deafness-2 (DFNX2). Int. J. Pediatr. Otorhinolaryngol.. 2018. V. 104. . P. 94-97
Petrova E.A., Zhuk E.A., Popov A.G., Bondar A.A., Belokon M.M., Goroshkevich S.N., Vasilyeva G.V. Asymmetric introgression between Pinus sibirica and Pinus pumila in the Aldan plateau (Eastern Siberia). Silvae Genetica. 2018. V. 67. P. 66 – 71
Ilyinykh A.V., Baturina O.A., Ilyinykh F.A.,Podgwaite J.D., Polenogova O.V.,Belousova I.A., Martemyanov V.V., Kabilov M.R. Change in the virulence of the lymantria dispar nucleopolyhedrovirus during passage in the insect host. Int J. of Pure and Appl. Zoology. 2018. V. 6. N 2. P. 15-17
Baturina O.A., Pavlova O.N., Novikova A.S., Kabilov M.R., Zemskaya T.I. Draft Genome Sequence of Thermaerobacter sp. Strain PB12/ 4term, a Thermophilic Facultative Anaerobic Bacterium from Bottom Sediments of Lake Baikal, Russia. Microbiol. Resour. Ann.. 2018. V. 7. N 20. e01178-18
Matyugina E., Belkova N., Borzenko S.,Lukyanov P., Kabilov M.R., Baturina O.A.,Martynova-Van Kley., Nalian A., Ptitsyn A. Structure and diversity dynamics of microbial communities at day and night: investigation of meromictic Lake Doroninskoe, Transbaikalia, Russia Journal of Oceanology and Limnology. Journal of Oceanology and Limnology. 2018. V. 36. N 6. P. 1978–1992
Baturina O.A., Muntyan V.S., Cherkasova M.E., Saksaganskaya A.S., Dzuybenko N.I., Kabilov M.R., Roumiantseva M.L. Draft Genome Sequence of Sinorhizobium meliloti Strain AK170. Microbiol. Resour. Ann.. 2018. V. 8. N 1. e01571-18
Kashinskaya E.N., Simonov E.P., Kabilov M.R., Izvekova G.I., Andree K.B., Solovyev M.M. Diet and other environmental factors shape the bacterial communities of fish gut in an eutrophic lake. Journal of Applied Microbiology. 2018.
Kichigin I.G., Lisachov A.P., Giovannotti M., Makunin A.I., Kabilov M.R., O’Brien P.C. M., Ferguson‑Smith M.A.,Graphodatsky A.S., Trifonov V.A. First report on B chromosome content in a reptilian species: the case of Anolis carolinensis. Mol. Genet. Genomics. 2018.
Tsydenova B.V., Dagurova O.P., Garankina V.P., Dambaev V.B., Matafonov D.V., Baturina O.A. Abundance and Taxonomic Composition of Bacterioplankton in Freshwater Lake Gusinoye (Buryatia) in the Warm Water Zone of the Gusinoozerskaya Thermal Power Plant. Журнал СФУ. Серия: Биология. 2018. V. 11. N 4. P. 356-366.
Нуждина Н.С., Бондарь А.А., Дорогина О.В. Новые данные о таксономическом и географическом распространении делеции интрона trnLUAA хпДНК в роде Hedysarum L. (Fabaceae L.). Генетика. 2018. Т. 54. №11. С. 1263-1274
Наумова Н.Б., Аликина Т.Ю., Кузнецова Г.В. Биоразнообразие бактериальных ансамблей в буроземе элювиированном под сосной корейской. Почвы и окружающая среда. 2018. Т. 1. № 3. С. 151-169
Романов Г.П., Барашков Н.А., Терютин Ф.М., Лашин С.А., Соловьев А.В.,Пшенникова В.Г., Бондарь А.А., Морозов И.В., Сазонов Н.Н., Томский М.И.,Джемилева Л.У., Хуснутдинова Э.К.,Посух О.Л., Федорова С.А. Брачная структура, репродуктивные параметры и молекулярно-генетический анализ гена GJB2 (CX26) у глухих людей в Якутии. Генетика. 2018. Т.54. № 5. С. 547–555
Глотова Т.И., Семенова О.В., Никонова А.А., Глотов А.Г., Вяткин Ю.В., Бондарь А.А. Выделение и филогенетический анализ калицивируса кошек в Сибири. Вопросы вирусологии. 2018. Т. 63. № 6. С. 268-274

Rozhko T.V., Guseynov O.A., Guseynova V.E., Bondar A.A., Devyatlovskaya A.N., Kudryasheva N.S. Is bacterial luminescence response to low-dose radiation associated with mutagenicity? J Environ Radioact 2017. 177. 261–265
Lee D.-H., Sharshov K., Swayne D.E., Kurskaya O., Sobolev I., Kabilov M., Alekseev A., Irza V., Shestopalov A. Novel Reassortant Clade 2.3.4.4 Avian Influenza A(H5N8) Virus in Wild Aquatic Birds, Russia, 2016. Emerg Infect Dis 2017. 23. 2. 359–360
Sachkova A.S., Kovel E.S., Churilov G.N., Guseynov O.A., Bondar A.A., Dubinina I.A., Kudryasheva N.S. On mechanism of antioxidant effect of fullerenols. Biochem Biophys Rep 2017. 9. 1–8
Solovyev A.V., Dzhemileva L.U., Posukh O.L., Barashkov N.A., Bady-Khoo M.S., Lobov S.L., Popova N.Y., Romanov G.P., Sazonov N.N., Bondar A.A., Morozov I.V., Tomsky M.I., Fedorova S.A., Khusnutdinova E.K. Opinions of hearing parents about the causes of hearing impairment of their children with biallelic GJB2 mutations. J Community Genet 2017. 8. 3. 167–171
Grosheva A.S., Zharkov D.O., Stahl J., Gopanenko A.V., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Graifer D.M., Karpova G.G. Recognition but no repair of abasic site in single-stranded DNA by human ribosomal uS3 protein residing within intact 40S subunit. Nucleic Acids Res 2017. 45. 7. 3833–3843
Martemyanov V.V., Podgwaite J.D., Belousova I.A., Pavlushin S.V., Slavicek J.M., Baturina O.A., Kabilov M.R., Ilyinykh A.V. A comparison of the adaptations of strains of Lymantria dispar multiple nucleopolyhedrovirus to hosts from spatially isolated populations. J Invertebr Pathol 2017. 146. 41–46
Bernhem K., Krishnan K., Bondar A., Brismar H., Aperia A., Scott L. AT1-receptor response to non-saturating Ang-II concentrations is amplified by calcium channel blockers. BMC Cardiovasc Disord 2017. 17. 126. 1–10
Brouchkov A., Kabilov M., Filippova S., Baturina O., Rogov V., Galchenko V., Mulyukin A., Fursova O., Pogorelko G. Bacterial community in ancient permafrost alluvium at the Mammoth Mountain (Eastern Siberia). Gene 2017. 636. 48–53
Kossinova O.A., Gopanenko A.V., Tamkovich S.N., Krasheninina O.A., Tupikin A.E., Kiseleva E., Yanshina D.D., Malygin A.A., Ven’yaminova A.G., Kabilov M.R., Karpova G.G. Cytosolic YB-1 and NSUN2 are the only proteins recognizing specific motifs present in mRNAs enriched in exosomes. Biochim Biophys Acta-Proteins and Proteomics 2017. 1865. 6. 664–673
Kudryasheva N.S., Petrova A.S., Dementyev D.V., Bondar A.A. Exposure of luminous marine bacteria to low-dose gamma-radiation. J Environ Radioact 2017. 169–170. 64–69
Sobolev I., Kurskaya O., Murashkina T., Leonov S., Sharshov K., Kabilov M., Alikina T., Tolstykh N., Gorodov V., Alekseev A., Shestopalov A. Genome Sequence of an Unusual Reassortant H1N1 Swine Influenza Virus Isolated from a Pig in Russia, 2016. Genome Announc 2017. 5. 36. e00747-17
Belkova N.L., Sidorova T.V., Glyzina O.Y., Yakchnenko V.M., Sapozhnikova Y.P., Bukin Y.S., Baturina O.A., Sukhanova L.V. Gut microbiome of juvenile coregonid fishes: comparison of sympatric species and their F1 hybrids. Fundam Appl Limnol 2017. 189. 3. 279–290
Gopanenko A.V., Malygin A.A., Tupikin A.E., Laktionov P.P., Kabilov M.R., Karpova G.G. Human ribosomal protein eS1 is engaged in cellular events related to processing and functioning of U11 snRNA. Nucleic Acids Res 2017. 45. 15. 9121–9137
Пшенникова В.Г., Барашков Н.А., Соловьев А.В., Романов Г.П., Дьяконов Е.Е., Сазонов Н.Н., Морозов И.В., Бондарь А.А., Посух О.Л., Джемилева Л.У., Хуснутдинова Э.К., Томский М.И., Федорова С.А. Поиск мутаций в генах GJB6 (Сх30) и GJB3 (Сх31) у глухих пациентов с моноаллельными мутациями гена GJB2 (Сх26) В Якутии. Генетика 2017. 53. 6. 705–715
Лаврентьева Е.В., Раднагуруева А.А., Банзаракцаева Т.Г., Базаров С.М., Бархутова Д.Д., Ульзетуева И.Д., Чернявский М.К., Кабилов М.Р., Хахинов В.В. Филогенетический анализ микробного мата в горячем источнике Гарга (Байкальская рифтовая зона) и разнообразие природных пептидаз. Вавиловский журнал генетики и селекции 2017. 21. 8. 959–963
Копать В.В., Чирак Е.Р., Кимеклис А.К., Сафронова В.И., Белимов А.А., Кабилов М.Р., Андронов Е.Е., Проворов Н.А. Эволюция генов FIXNOQP, кодирующих цитохромоксидазу с высоким сродством к кислороду, у ризобий и родственных им бактерий. Генетика 2017. 53. 7. 795–804
Давыдова А.С., Воробьева М.А., Кабилов М.Р., Тикунова Н.В., Пышный Д.В., Веньяминова А.Г. In vitro-селекция 2’-F-модифицированных РНК-аптамеров, проникающих внутрь бактериальных клеток Pseudomonas aeruginosa. Биоорг химия 2017. 43. 1. 68–74

Tupikin A.E., Kalmykova A.I., Kabilov M.R. Draft Genome Sequence of the Probiotic Bifidobacterium longum subsp. longum Strain MC-42 . Genome Announcements. 2016. V. 4. N 6. e01411-16
Morozova V.V., Kozlova Y.N., Shedko E., Kurilschikov A.M., Babkin I.V., Tupikin A.E., Yunusova A.Y., Chernonosov A.A., Baykov I.K., Rondratov I., Kabilov M.R., Ryabchikova E.I., Vlassov V.V., Tikunova N.V. Lytic bacteriophage PM16 specific for Proteus mirabilis: a novel member of the genus Phikmvvirus . Archives of Virology. 2016. V. 161. N 9. P. 2457-2472
Martemyanov V.V., Belousova I.A., Pavlushin S.V., Dubovskiy I.M., Ershov N.I., Alikina T.Y., Kabilov M.R., Glupov V.V. Phenological asynchrony between host plant and gypsy moth reduces insect gut microbiota and susceptibility to Bacillus thuringiensis . Ecology and Evolution. 2016. V. 6. N 20. P. 7298–7310
Pavlova O.N., Zemskaya T.I., Lomakina A.V., Shubenkova O.V., Manakov A.Y., Moskvin V.I., Morozov I.V., Bukin S.V., Khlystov O.M. Transformation of Organic Matter by a Microbial Community in Sediments of Lake Baikal under Experimental Thermobaric Conditions of Protocatagenesis . Geomicrobiology Journal. 2016. V. 33. N 7, 8. P. 599-606
Kabilov M.R., Alikina T.Y., Yurchenko K.S., Glushchenko A.V., Gunbin K.V., Shestopalov A.M., Gubanova N.V. Complete Genome Sequences of Two Newcastle Disease Virus Strains Isolated from a Wild Duck and a Pigeon in Russia . Genome Announcements. 2016. V. 4. N 4. e01348-16
Sobolev I.A., Sharshov K., Yurchenko K., Korneev D., Glushchenko A., Alikina T.Y., Kabilov M.R., Bi Y., Liu W., Gubanova N., Shestopalov A. Characterization of avian paramyxovirus type 6 isolated from a Eurasian teal in the intersection of migratory flyways in Russia . Archives of Virology. 2016. V. 161. N 11. P. 3275-3279
Ilyicheva T., Durymanov A., Susloparov I., Kolosova N., Goncharova N., vyatchenko S., Petrova O., Bondar A.A., Mikheev V., Ryzhikov A. Fatal cases of seasonal influenza in Russia in 2015-2016 . PloS ONE. 2016. V. 11. N 10. e0165332
Kichigin I.G., Giovannotti M., Makunin A.I., Ng B. L., Kabilov M.R., Tupikin A.E., Barucchi V.C., Splendiani A., Ruggeri P., Rens W., O’Brien P.C. M., Ferguson‑Smith M.A., Graphodatsky A.S., Trifonov V.A. Evolutionary dynamics of Anolis sex chromosomes revealed by sequencing of flow sorting‑derived microchromosome‑specific DNA . Mol. Genet. Genomics.. 2016. V. 291. N 5. P. 1955–1966
Barashkov N.A., Pshennikova V.G., Posukh O.L., Teryutin FM., Solovyev A.V., Klarov L, A., Romanov G.P., Gotovtsev N.N., Kozhevnikov A.A., Kirillina E.V., Sidorova O.G., Vasilyevа L.M., Fedotova E.E., Morozov I.V., Bondar A.A., Solovyevа N.A., Kononova S.K., Rafailov A.M., Sazonov N.N., Alekseev A.N., Tomsky M.I., Dzhemileva L.U., Khusnutdinova E.K., Fedorova S.A. Spectrum and Frequency of the GJB2 Gene Pathogenic Variants in a Large Cohort of Patients with Hearing Impairment Living in a Subarctic Region of Russia (the Sakha Republic). . PloS ONE. 2016. V. 11. N 5. e0156300
Марченков А.М., Бондарь А.А., Петрова Д.П., Хабудаев К.В., Галачьянц Ю.П., Захарова Ю.Р., Волокитина Н.А. Грачёв М.А. Необычная конфигурация генов белка транспорта кремния у пресноводной пеннатной диатомеи Synedra acus subsp. radians . Доклады Академии Наук (биохимия, биофизика, молекулярная биология). 2016. Т. 471. № 2. С. 238–240
Кулакова О.Г., Кабилов М.Р., Данилова Л.В., Попова Е.В., Батурина О.А., Царева Е.Ю., Баулина Н.М., Киселев И.С., Бойко А.Н., Фаворов А.В., Фаворова О.О., Власов В.В. Полногеномный анализ метилирования ДНК мононуклеарных клеток крови больных различными формами рассеянного склероза . Acta Naturae. 2016. Т. 8. № 3 (30). C. 113-121
Dubovskiy I.M., Grizanova E.V., Whitten M.A.A., Mukherjee K., Greig C., Alikina T.Y., Kabilov M.R., Vilcinskas A., Glupov V.V., Butt T.M. Immuno-physiological adaptations confer wax moth Galleria mellonella resistance to Bacillus thuringiensis. Virulence. 2016. V. 7. N8. P. 860-870
Bian C., Hu Y., Ravi V., Kuznetsova I.S., Shen X., Mu X., Sun Y., You X., Li J., Li X., Qiu Y., Tay B-H., Thevasagayam N.M., Komissarov A.S., Trifonov V., Kabilov M.R., Tupikin A.E., Luo J., Liu Y., Song H., Liu C., Wang X., Gu D., Yang Y., Li W., Polgar G., Fan G., Zeng P., Zhang H., Tang Z., Peng C., Ruan Z., Yu H., Chen J., Fan M., Huang Y., Wang M., Zhao X., Hu G., Yang H., Wang J., Wang J., Xu X., Song L., Xu G., Xu P., Xu J., O’Brien S.J., Orbán L., Venkatesh B & Shi Q. The Asian arowana (Scleropages formosus) genome provides new insights into the evolution of an early lineage of teleosts. Scientific Reports. 2016. 6 P. 24501
Сhurbanov A.Y., Karafet T.M., Morozov I.V., Mikhalskaia V.Y., Zytsar M.V., Bondar A.A., Posukh O.L. Whole Exome Sequencing Reveals Homozygous Mutations in RAI1, OTOF, and SLC26A4 Genes Associated with Nonsyndromic Hearing Loss in Altaian Families (South Siberia). PloS ONE. 2016. V. 11 N 4 e0153841
Vij S, Kuhl H, Kuznetsova IS, Komissarov A, Yurchenko AA, Van Heusden P, Singh S, Thevasagayam NM, Prakki SR, Purushothaman K, Saju JM, Jiang J, Mbandi SK, Jonas M, Hin Yan Tong A, Mwangi S, Lau D, Ngoh SY, Liew WC, Shen X, Hon LS, Drake JP, Boitano M, Hall R, Chin CS, Lachumanan R, Korlach J, Trifonov V, Kabilov M.R., Tupikin A.E., Green D, Moxon S, Garvin T, Sedlazeck FJ, Vurture GW, Gopalapillai G, Kumar Katneni V, Noble TH, Scaria V, Sivasubbu S, Jerry DR, O'Brien SJ, Schatz MC, Dalmay T, Turner SW, Lok S, Christoffels A, Orbán L. Chromosomal-Level Assembly of the Asian Seabass Genome Using Long Sequence Reads and Multi-layered Scaffolding. PLoS Genetics. 2016. V. 12 N 4 e1005954
Григорьева А.Е., Тамкович С.Н., Еремина А.В., Тупикин А.Е., Кабилов М.Р., Черных В.В., Лактионов П.П., Рябчикова Е.И. Экзосомы слезной жидкости здоровых людей: выделение, идентификация и характеризация Биомедицинская химия. 2016. Т. 2 № 1 С. 99-106
Baturina O.A., Morozov I.V. Comparative Analysis of Phenylalanine Hydroxylase Mutations Spectrum in Novosibirsk and Kemerovo regions of Western Siberia, Russia. European Journal of Medicine. 2016. V. 11 N 1 P. 1-11
Kirillova I.V., Argant J., Lapteva E.G., Korona O.M., J. van der Plicht., Zinovyev E.V., Kotov A.A., Chernova O.F., Fadeeva E.O., Baturina O.A., Kabilov M.R., Shidlovskiy F.K., Zanina O.G. The diet and environment of mammoths in North-East Russia reconstructed from the contents of their feces. Quaternary International. 2016. V. 406B, P. 1-15

Каримов М.З., Бакиров И.Х., Вафин Р.Р., Равилов Р.Х., Тюлькин С.В., Тупикин А.Е., Ахметов Т.М.. Молекулярный анализ PMP-генов штамма хламидий ПП-87, кодирующих полиморфные белки наружной мембраны . Современные проблемы науки и образования. 2015. №6. С. 1-9.
Барашков Н.А., Кларов Л.А., Терютин Ф.М., Соловьев А.В., Пшенникова В.Г., Конникова Э.Э., Николаева К.Ю., Романов Г.П., Готовцев Н.Н., Саввинова К.Е., Кожевников А.А., Васильева Л.М., Федотова Э.Е., Пак М.В., Леханова С.Н., Лугинов Н.В., Морозов И.В., Бондарь А.А., Соловьева Н.А., Рафаилов А.М., Сазонов Н.Н., Алексеев А.Н., Посух О.Л., Джемилева Л.У., Хуснутдинова Э.К., Федорова С.А.. Новая нонсенс-мутация p.Trp325Ter (c.977G>A) гена POU3F4 в якутской семье с синдромом Gusher (DFNX2) . Медицинская генетика. . 2015. №8. C. 25-36.
Башмакова Е.Е., Красицкая В.В., Бондарь А.А., Козлова А.В., Рукша Т.Г., Франк Л.А.. Выявление однонуклеотидных полиморфизмов (R160W, R151C, D294H) в гене рецептора меланокортина-1 (MC1R) биолюминесцентным анализом . Молекулярная биология. . 2015. Т. 49. №6. С. 953–958.
Пшенникова В.Г., Барашков Н.А., Терютин Ф.М., Соловьев А.В., Кларов Л.А., Романов Г.П., Готовцев Н.Н., Саввинова К.Е., Кожевников А.А., Сидорова О.Г., Васильева Л.М., Федотова Э.Е., Морозов И.В., Бондарь А.А., Соловьева Н.А., Кононова С.К., Рафаилов А.М., Сазонов Н.Н., Алексеев А.Н., Посух О.Л., Джемилева Л.У., Хуснутдинова Э.К., Федорова С.А.. Анализ спектра и частоты GJB2-мутаций у пациентов с врожденными нарушениями слуха в Республике Саха . Медицинская генетика. . 2015. №6 (156). С.10-23.
Мартемьянов В.В., Кабилов М.Р., Тупикин А.Е., Батурина О.А., Белоусова И.А., Поджвайт Дж. Д., Ильиных А.В., Власов В.В. Ген энхансина – одна из генетических детерминант популяционной изменчивости вирулентности бакуловирусов. Доклады Академии Наук. 2015. Т. 465. № 1. С. 108–110
Chernova O.F., Kirillova I.V., Boeskorov G.G., Shidlovskiy F.K., Kabilov M.R. Architectonics of the hairs of the woolly mammoth and woolly rhino. Proceedings of the Zoological Institute. 2015. V.319. N3 P. 441-460
Naumova N.B., Kuznetsova G.V., Alikina T.Y., Kabilov M.R. Bacterial 16S DNA diversity in the rhizosphere soil of the two pine species. Biomics, 2015, Vol. 7, No 2, P. 128-137.
Kurilschikov A.M., Livanova N.N., Fomenko N.V., Tupikin A.E., Rar V.A., Kabilov M.R., Livanov S.G., Tikunova N.V. Comparative Metagenomic Profiling of Symbiotic Bacterial Communities Associated with Ixodes persulcatus, Ixodes pavlovskyi and Dermacentor reticulatus Ticks. PloS ONE. 2015. V. 10. N7. e0131413.
Kashinskaya E.N., Belkova N.L., Izvekova G.I., Simonov E.P., Andree K.B., Glupov V.V., Baturina O.A., Kabilov M.R., Solovyev M.M. A comparative study on microbiota from the intestine of Prussian carp (Carassius gibelio) and their aquatic environmental compartments, using different molecular methods. Journal of Applied Microbiology, 2015, V.119, N4, P. 948-961.
Валетдинова К.Р., Устьянцева Е.И., Елисафенко Е.А., Жарков Д.О., Тупикин А.Е., Кабилов М.Р., Медведев С.П., Закиян С.М. Инструменты геномной инженерии, предназначенные для создания изогенной клеточной модели бокового амиотрофического склероза. Медицинская генетика. 2015. Т. 14. № 6. С. 3-9
Фоменко Н.В., Хворостова Ю.В., Игнатьева О.А., Трухина А.В., Гасилова Н.А., Кабилов М.Р., Иванов М. К. Видовое разнообразие микрофлоры в пробах из урогенитального тракта пациенток крупной сетевой лаборатории и его зависимость от содержания лактобактерий. Клиническая лабораторная диагностика. 2015. Т. 60. № 3. С. 59-64
Терютин Ф.М., Барашков Н.А., Кунельская Н.Л., Пшенникова А.В., Соловьев А.В., Кларов Л.А., Кожевников Л.М., Васильева Л.М., Федотова Э.Е., Романов Г.П., Готовцев Н.Н., Пак М.В., Леханова С.Н., Морозов И.В., Бондарь А.А., Соловьева Н.А., Рафаилов А.М., Алексеев А.Н., Посух О.В., Джемилева Л.У., Хуснутдинова Э.К., Федорова С.А. Вариабельность порогов слуха у глухих пациентов, гомозиготных по мутации С.-23+1G>A гена GJB2 (коннексин 26). Якутский медицинский журнал. 2015. №2. С. 100-103
Kabilov M.R., Martemyanov V.V., Tupikin A.E., Baturina O.A., Belousova I.A., Bondar A.A., Ilyinykh A.V. Complete Genome Sequence of a Western Siberian Lymantria dispar Multiple Nucleopolyhedrovirus Isolate. Genome Announcements. 2015. V. 3. N 2. e00335-15
Dryomov S.V., Nazhmidenova A.M., Shalaurova S.A., Morozov I.V., Tabarev A.V., Starikovskaya E.B., Sukernik R.I. Mitochondrial genome diversity at the Bering Strait area highlights prehistoric human migrations from Siberia to northern North America. Eur. J. Hum. Genet. 2015. V. 23. N 10. P. 1399-1404
Zemskaya T.I., Lomakina A.V., Shubenkova A.V., Pogodaeva T.V., Morozov I.V., Chernitsina S.M., Sitnikova T.Y., Khlystov O., Egorov A.V. Jelly-like Microbial Mats over Subsurface Fields of Gas Hydrates at the St. Petersburg Methane Seep (Central Baikal). Geomicrobiology Journal. 2015. V. 32. P. 89–100

Kurilschikov A.M., Fomenko N.V., Stronin O.V., Tikunov A., Kabilov M.R., Tupikin A.E., Tikunova N.V. Complete Genome Sequencing of Borrelia valaisiana and Borrelia afzelii Isolated from Ixodes persulcatus Ticks in Western Siberia. Genome Announcements. 2014. V. 24. N2(6) e01315-14.
Lomakin YA, Zakharova MY, Stepanov AV, Dronina MA, Smirnov IV, Bobik TV, Pyrkov AY, Tikunova NV, Sharanova SN, Boitsov VM, Vyazmin SY, Kabilov MR, Tupikin AE, Krasnov AN, Bykova NA, Medvedeva YA, Fridman MV, Favorov AV, Ponomarenko NA, Dubina MV, Boyko AN, Vlassov VV, Belogurov AA Jr, Gabibov AG. Heavy-light chain interrelations of MS-associated immunoglobulins probed by deep sequencing and rational variation. Mol Immunol. 2014. 62(2):305-14
Baturina O.A., Tupikin A.E., Lukjanova T.V., Sosnitskaya S.V., Morozov I.V. PAH and QDPR deficiency associated mutations in the Novosibirsk region of the Russian Federation: correlation of mutation type with disease manifestation and severity. Journal of medical biochemistry. 2014. V. 33. P. 333–340
Chaplin A.V., Efimov B.A., Khokhlova E.V., Kafarskaia L.I., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Shkoporov A.N. Draft Genome Sequence of Coprobacter fastidiosus NSB1T. Genome Announcements. 2014. V.2 N2. P.e00122-14
Sykilinda N.N., Bondar A.A., Gorshkova A.S., Kurochkina L.P., Kulikov E.E., Shneider M.M., Kadykov V.A., Solov'eva N.V., Kabilov M.R., Mesyanzhinov V.V., Vlassov V.V., Drukker V.V., Miroshnikov K.A. Complete genome sequence of the novel giant pseudomonas phage PaBG. Genome Announcements. 2014. V.2 N1. P.e00929-13
Vayner A.S., Boyarskikh U.A., Voronina E.N., Tupikin A.E., Korolkova O.V., Morozov I.V., Filipenko M.L. Polymorphisms in folate-metabolizing genes and risk of idiopathic male infertility: a study on a Russian population and a meta-analysis. Fertility and Sterility. 2014. V.101, N1, P. 87–94.e3
Бады-Хоо М.С., Бондарь А.А., Морозов И.В., Зыцарь М.В., Михальская В.Ю., Скиданова О.В., Барашков Н.А., Монгуш Р.Ш., Омзар О.С., Тукар В.М., Посух О.В. Изучение наследственных форм тугоухости / глухоты в Республике Тыва. Cообщение II. Оценка спектра мутаций гена GJB2 (Cx26) и их вклада в этиологию потери слуха. Медицинская генетика. 2014. № 11. С. 23-33.
Каримов М.З., Бакиров И.Х., Вафин Р.Р., Равилов Р.Х., Тюлькин С.В., Кабилов М.Р., Зайнуллин Л.И., Ахметов Т.М. Молекулярный анализ ассамблеи генов штамма хламидий ПП-87, близлежащих к pros-гену, кодирующему пролил-тРНК-синтетазу. Фундаментальные исследования. 2014. № 11(7). С. 1098-1103
Васюткина Е.А., Реунова Г.Д., Тупикин А.Е., Журавлев Ю.Н. Изменчивость митохондриальной ДНК лиственницы ольгинская (Larix olgensis A. Henry) в Приморском крае России. Генетика. 2014. т.50, №3 с. 291-298
Ломакина А.В., Погодаева Т.В., Морозов И.В., Земская Т.И. Микробные сообщества зоны разгрузки газонефтесодержащих флюидов ультрапресного озера Байкал. Микробиология. 2014. Т. 83, №3, С. 355–365
Дрюккер В.В., Дутова Н.В., Сыкилинда Н.Н., ГоршковаА.С., Бондарь А.А. Вириопланктон - новое трофическое звено в экосистеме олиготрофного озера Байкал. Разв. жизни в проц. абиот. изм. на Земле. 2014, № 3, С. 342-347